回到传送室这边，那个自称是尚恩的小男孩称呼主角为妈妈（爸爸），他只是一名合成实验体，此时可选择带走他或者拒绝。
用传送机来到远处的建筑天台，主角按下了引爆器的按钮。轰隆一声巨响，火光烛天，整座学院化为废墟，连同它的逆天科技。
结局动画
世界末日再度降临了，我闭上双眼，看见在这一切之前，核弹落下前的人生。
什么事都可能在转瞬间风云变色，你所规划的未来也会瞬间变样，无论你是否做好准备。人的一生中，总是会碰到这种事。
这不是我想要的世界，但我身陷其中。联邦，我的家园，分分合合。我以为，我希望……我能再次找到家人，骗过时光，再次团圆，回到从前的样子。
现在我明白了，我明白世界已经变了，前方的路将会困难险阻。我已做好准备，因为我了解战争。
战争永远不变。
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几十年的努力，终于摧毁了学院的强权科技，使得铁路组织的愿景得以实现。
至此，铁路路线的主线任务完结。
不过，仇恨仍在土壤里深深扎根，学院的合成年人仍散落各地，会挑选适当时机反扑。主角重担在肩，不能松懈。
