选择3：三势力和平共处
在拿到核武钥匙后，和阿卡迪亚的迪玛交谈，试图找出终结这场冲突的方法。
主角说出找到艾菲莉尸骨的事情，迪玛想起自己杀害了一个远港镇的女人，换成年人造人成为卧底。
迪玛让主角保守这个秘密，因为远港镇一旦知道此事，会全力攻袭阿卡迪亚。而迷雾冷凝器最后没人修复，所有的人都会死。
主角答应帮他保密。
根据以上的谈话，迪玛会给出一个平息原子教的解决方案，用人造人替换大司祭泰克图斯，这样原子教就愿意和远港镇达成谅解。
此计划是想办法接近大司祭，把他引诱到隐密的地方，解决掉他，之后会派人造人接手替换。
大司祭很怕被归来的马丁夺位，如果主角拿到马丁司祭即将归来的证据，就能诱出泰克图斯。现在要假造马丁现身的事，需要收集一些录音素材，用来模拟他的声音。
对话结束，收到谢礼-阿卡迪亚的庇护。敏捷、智力、耐力各+1。得到一把磨损的钥匙。
同时完成主线任务“生活的本貌”，开始主线任务“改革”，这个任务是包含在“净化陆地”之中的。
前往马丁的隐居处，在一根水管里边找到密室的门，用磨损的钥匙开门进去。
在屋子里拾取并播放全像卡带“判决”和“原子之神的指示”，听取马丁和迪玛的一些对话内容。桌子上还有两份文件，阅读了解一下背景。
将两份全像卡带交给迪玛，得到卡带“马丁的新纪元”。
前往原子教，对大司祭说马丁打算回来掌权，两人应该避开教会的耳目，到指挥中心的通道讨论一下对策。将卡带“马丁的新纪元”播放给他听，大司祭答应赴会。
前往指挥中心，在会面地点解决掉赶来的大司祭，然后藏匿证物。
返回阿卡迪亚，看到那个假的大司祭泰克图斯前来议和。
这也代表着这座岛终于和平，三派势力得以共存。如同迪玛所说，现在原子核会、远港镇和阿卡迪亚一起茁壮成长。主线任务“净化陆地”和“改革”同时完成。解锁任务“离家不远”。
回到原子教会找大司祭谈话，得到任务报酬-原子之神堡垒，是一副护甲，吸收辐射后增加伤害抗性和能量抗性。
