《精灵宝可梦Let's Go 皮卡丘/伊布》中有一些宝可梦的出现率很低，很难获得，而且每个位置都不太一样，妙蛙种子需要到华蓝市的小屋里面，然后当玩家抓了30只宝可梦时和NPC对话就能获得。更多如下。
宝可梦letsgo稀有精灵捕捉地点
妙蛙种子
华蓝市小屋内，当玩家捕捉30只宝可梦时即可与NPC对话获得。
小火龙
黄金大桥24号道路，当玩家捕捉50只宝可梦时即可与NPC对话获得。
杰尼龟
枯叶市，当玩家捕捉60只宝可梦时即可与NPC对话获得。
拉普拉斯
金黄市西尔佛公司，需先拿到电子钥匙卡开门备用，坐电梯到达7楼，打开电子门，与科学家互动即可。
卡比兽
紫苑镇下方12号道路，需先攻略紫苑镇最顶层，拿到宝可梦笛，吹响笛子唤醒卡比兽，与之战斗后捕捉。
化石盔&菊石兽
月见山里面会发现贝壳化石与甲壳化石，只能选择其中一个，带去红莲镇的研究所进行孵化，前者为菊石兽，后者为化石盔。
化石翼龙
深灰市科技博物馆右侧后门处，玩家可以与科学家进行互动获得神秘琥珀，带到红莲镇的研究所进行孵化。
多边兽(3D龙)
金黄市宝可梦急救中心门口左侧的男士，与之对话互动即可。
